打捞“江亚号”客轮的计划始于1949年初。招商局先通过驻日代表团从东京聘请打捞专家8人于1月17日抵沪。20日，由招商局海事课课长范仑陪同，乘“济安”轮前往出事地点勘察。因风浪大于25日返回。3月中旬，日本打捞商再度来沪，预算全部打捞费需19万美元。后来，招商局又请了一个美国打捞商到沉船地点观察，认为没有办法打捞，只能炸掉它。以后由于潮水冲击等原因，“江亚号”客轮逐渐断裂成两段。

　　1956年，上海市人民政府从政治角度考虑，同时也为清理航道，决定打捞“江亚号”客轮。当年第二季度，打捞工程局开始施工。至8月20日捞起后半部分，并随后抬捞进港。10月30日，沉船的前半部分也被抬捞至宝山附近浅滩搁置。前后历时160余天，终于使沉埋江底的“江亚号”客轮重见天日。

　　在打捞过程中，成立了专门的骨骸、物资收集小组，不论是一节残损的骨骸还是一件很小的首饰，他们都想办法将其捞出。有的死者头骨里满是烂泥，打捞工人们就用水把它冲洗干净，然后装箱。对所有捞获的物资，均由拾到人、收集人会同行政领导人当场点清、盖章、密封，然后送打捞工程局保管，统一交上海市人民委员会处理。据统计，这次打捞共捞获不完整的骨骸2大箱、4小箱，各类首饰上千件、大小金条21根。此外还有钻戒、宝石戒、银元、银器、外币等。这些物品除其中少数的有私人印记还可以辨认外，绝大部分无特殊标记。

　　“江亚号”客轮的打捞受到上海各界人民的关注，更牵动着死难者家属的心。不少人纷纷写信给上海市人民委员会以及上海打捞工程局，打听打捞工程的进展，打听“江亚号”客轮沉没的原因，希望见到亲人的骨骸，将他们妥善安葬。也有的希望能亲眼看到打捞起来的“江亚号”客轮，希望到该轮沉没的地方去吊唁死难者的冤魂。在国民党中央银行任过职的黄体安，他的母亲和他的结婚才11个月已怀孕的妻子均惨死在“江亚号”客轮中，尸首一直没有找到，当年他还特地跑到轮船沉没地的江边，哀求那里的潜水员帮他寻找亲人的骨骸，可是一直没有找到。事后他曾多次在黄浦江边徘徊、眺望，默默地度过了那个漫长阴冷的冬天。当他得知人民政府打捞“江亚号”客轮的消息后，立即给政府写信：“请允许我再看一次‘江亚号’客轮吧，我的母亲和妻子是坐在该船头等舱三号房间里的……”

　　1957年2月16日和2月20日，人民委员会分两次组织了部分遇难者家属和脱险生还者参观打捞起来的“江亚号”客轮残骸。委员会在多次召开座谈会听取死难者家属的意见和要求后，决定清明节前在古北路永安公墓为“江亚号”客轮死难者骨骸举行安葬仪式。1957年3月19日，350多位死难者家属带着鲜花和香烛，前往参加安葬仪式，凭吊他们的亲人。

　　1957年4月23日，人民委员会公布了从“江亚号”客轮捞获的物资善后处理账目。总计捞获物资（除发还给家属的物品外）折价为29400余元，由委员会移交上海市救济会统一处理。至此，“江亚号”客轮的善后处理工作结束。